Paket: daligner (1.0+git20240119.335105d-3 och andra)

[ Källkod: daligner  ]

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

These tools permit one to find all significant local alignments between reads encoded in a Dazzler database. The assumption is that the reads are from a Pacific Biosciences RS II long read sequencer. That is, the reads are long and noisy, up to 15% on average.

Märken: Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Andra paket besläktade med daligner

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Hämta daligner

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1.0+git20240119.335105d-3	236,0 kbyte	1.626,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.0+git20240119.335105d-3+b1	208,1 kbyte	1.931,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.0+git20240119.335105d-3	198,3 kbyte	1.520,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.0+git20240119.335105d-3	198,1 kbyte	1.128,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.0+git20240119.335105d-3	227,6 kbyte	1.756,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.0+git20240119.335105d-3	195,5 kbyte	2.039,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.0+git20240119.335105d-3	231,4 kbyte	2.186,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.0+git20240119.335105d-3	226,8 kbyte	1.238,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.0+git20240119.335105d-3	240,3 kbyte	1.788,0 kbyte	[filförteckning]