Пакет: murasaki (1.68.6-14 и други)

[ Източник: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Други пакети, свързани с murasaki

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostreams Library

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, riscv64]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Изтегляне на murasaki

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1.68.6-14+b1	629,6 кБ	4 400,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.68.6-14+b1	543,3 кБ	4 319,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.68.6-14	452,9 кБ	3 326,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.68.6-14	462,8 кБ	2 350,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.68.6-14	638,5 кБ	4 166,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.68.6-14+b1	596,1 кБ	5 866,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.68.6-14+b1	606,8 кБ	5 600,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.68.6-14+b1	584,6 кБ	3 203,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.68.6-14+b1	606,9 кБ	4 827,0 кБ	[списък на файловете]