Pakiet: r-cran-bio3d (2.4-5-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: r-cran-bio3d  ]

GNU R package for biological structure analysis

The bio3d package contains utilities to process, organize and explore protein structure, sequence and dynamics data. Features include the ability to read and write structure, sequence and dynamic trajectory data, perform atom summaries, atom selection, re-orientation, superposition, rigid core identification, clustering, torsion analysis, distance matrix analysis, structure and sequence conservation analysis, and principal component analysis (PCA). In addition, various utility functions are provided to enable the statistical and graphical power of the R environment to work with biological sequence and structural data.

Inne pakiety związane z r-cran-bio3d

• dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nie ia64, m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.2.1-3) [ia64]

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

• rec: clustalo

  General-purpose multiple sequence alignment program for proteins

• rec: dssp

  Ustalanie drugorzędowej struktury białek na podstawie struktury 3D

• rec: muscle

  Multiple alignment program of protein sequences

• rec: mustang

  Wielokrotne strukturalne dopasowanie białek

• rec: r-bioc-biostrings [nie armel, armhf, i386, ia64]

  GNU R string objects representing biological sequences

• rec: r-cran-bigmemory [nie ia64]

  Manage Massive Matrices with Shared Memory and Memory-Mapped Files

• rec: r-cran-httr [nie ia64]

  GNU R tools for working with URLs and HTTP

• rec: r-cran-igraph [nie ia64]

  GNU R network analysis and visualization

• rec: r-cran-knitr [nie ia64]

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• rec: r-cran-lattice [nie ia64]

  Pakiet GNU R do grafiki "Trellis"

• rec: r-cran-ncdf4 [nie ia64]

  GNU R interface to Unidata netCDF format data files

• rec: r-cran-rcurl [nie ia64]

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• rec: r-cran-rmarkdown [nie ia64]

  convert R markdown documents into a variety of formats

• rec: r-cran-testthat (>= 0.9.1)

  GNU R testsuite

• rec: r-cran-xml [nie ia64]

  Pakiet GNU R do analizowania i tworzenia plików XML

• sug: r-bioc-biostrings

  GNU R string objects representing biological sequences

• sug: r-cran-bigmemory

  Manage Massive Matrices with Shared Memory and Memory-Mapped Files

• sug: r-cran-httr

  GNU R tools for working with URLs and HTTP

• sug: r-cran-igraph

  GNU R network analysis and visualization

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-lattice

  Pakiet GNU R do grafiki "Trellis"

• sug: r-cran-ncdf4

  GNU R interface to Unidata netCDF format data files

• sug: r-cran-rcurl

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-xml

  Pakiet GNU R do analizowania i tworzenia plików XML

Pobieranie r-cran-bio3d

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.4-5-1	2 911,4 KiB	3 998,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.4-5-1	2 910,9 KiB	3 980,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.4-5-1	2 903,8 KiB	4 000,0 KiB	[lista plików]
armel	2.4-5-1	2 899,7 KiB	3 935,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.4-5-1	2 904,7 KiB	3 935,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.4-5-1+b1	2 906,9 KiB	3 977,0 KiB	[lista plików]
i386	2.4-5-1	2 923,6 KiB	3 979,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.4-4-1	2 900,0 KiB	4 187,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	2.4-5-1	2 904,4 KiB	3 998,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.4-5-1	2 908,8 KiB	3 941,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.4-5-1	2 896,6 KiB	4 014,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.4-5-1	2 905,6 KiB	4 068,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.4-5-1	2 906,4 KiB	4 000,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.4-5-1	2 914,0 KiB	3 924,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.4-5-1	2 915,8 KiB	3 976,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.4-5-1	2 928,3 KiB	3 997,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.4-5-1	2 896,6 KiB	4 774,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.4-5-1	2 913,9 KiB	3 953,0 KiB	[lista plików]