Paket: r-cran-bio3d (2.4-5-1 und andere)

[ Quellcode: r-cran-bio3d  ]

GNU-R-Paket für biologische Strukturanalyse

Das Paket bio3d bietet Methoden zur Verarbeitung, Organisation und interaktiven Untersuchung von Daten zu Protein-Struktur, -Sequenz und -Dynamik. Dies beinhaltet Funktionen zum Lesen und Schreiben von Strukturen, Sequenzen und den Trajektorien der Moleküldynamik, die Zusammenfassung von Informationen zu Atomen, deren Selektion, Ausrichtung, Überlagerung, rigid core identification, Clustering, Winkel-Untersuchung, Untersuchungen von Distanz-Matrizen, Betrachtung der Erhaltung von Struktur und Sequenz und die Hauptkomponentenanalyse. Zudem werden vielfältige Anpassungen angeboten, um auf die mächtigen Funktionen zur Statistik und der graphischen Repräsentation von GNU R zurückgreifen zu können.

Andere Pakete mit Bezug zu r-cran-bio3d

• dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nicht ia64, m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: r-api-4.0

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.2.1-3) [ia64]

  GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

• dep: r-cran-rcpp

  GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nicht armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

• rec: clustalo

  General-purpose multiple sequence alignment program for proteins

• rec: dssp

  protein secondary structure assignment based on 3D structure

• rec: muscle

  Multiple alignment program of protein sequences

• rec: mustang

  Struktur-Alignment mehrerer Proteine

• rec: r-bioc-biostrings [nicht armel, armhf, i386, ia64]

  GNU R string objects representing biological sequences

• rec: r-cran-bigmemory [nicht ia64]

  Manage Massive Matrices with Shared Memory and Memory-Mapped Files

• rec: r-cran-httr [nicht ia64]

  GNU R tools for working with URLs and HTTP

• rec: r-cran-igraph [nicht ia64]

  GNU R network analysis and visualization

• rec: r-cran-knitr [nicht ia64]

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• rec: r-cran-lattice [nicht ia64]

  GNU-R-Paket für »Trellis«-Grafiken

• rec: r-cran-ncdf4 [nicht ia64]

  GNU R interface to Unidata netCDF format data files

• rec: r-cran-rcurl [nicht ia64]

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• rec: r-cran-rmarkdown [nicht ia64]

  Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

• rec: r-cran-testthat (>= 0.9.1)

  GNU R testsuite

• rec: r-cran-xml [nicht ia64]

  GNU R package for XML parsing and generation

• sug: r-bioc-biostrings

  GNU R string objects representing biological sequences

• sug: r-cran-bigmemory

  Manage Massive Matrices with Shared Memory and Memory-Mapped Files

• sug: r-cran-httr

  GNU R tools for working with URLs and HTTP

• sug: r-cran-igraph

  GNU R network analysis and visualization

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-lattice

  GNU-R-Paket für »Trellis«-Grafiken

• sug: r-cran-ncdf4

  GNU R interface to Unidata netCDF format data files

• sug: r-cran-rcurl

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• sug: r-cran-rmarkdown

  Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

• sug: r-cran-xml

  GNU R package for XML parsing and generation

r-cran-bio3d herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.4-5-1	2.911,4 kB	3.998,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.4-5-1	2.910,9 kB	3.980,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.4-5-1	2.903,8 kB	4.000,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	2.4-5-1	2.899,7 kB	3.935,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	2.4-5-1	2.904,7 kB	3.935,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.4-5-1+b1	2.906,9 kB	3.977,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.4-5-1	2.923,6 kB	3.979,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.4-4-1	2.900,0 kB	4.187,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	2.4-5-1	2.904,4 kB	3.998,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.4-5-1	2.908,8 kB	3.941,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.4-5-1	2.896,6 kB	4.014,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.4-5-1	2.905,6 kB	4.068,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.4-5-1	2.906,4 kB	4.000,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.4-5-1	2.914,0 kB	3.924,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.4-5-1	2.915,8 kB	3.976,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2.4-5-1	2.928,3 kB	3.997,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.4-5-1	2.896,6 kB	4.774,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.4-5-1	2.913,9 kB	3.953,0 kB	[Liste der Dateien]