Pakiet: r-bioc-scuttle (1.16.0+dfsg-3 i inne)

[ Pakiet źródłowy: r-bioc-scuttle  ]

BioConductor single-cell RNA-Seq analysis utilities

Provides basic utility functions for performing single-cell analyses, focusing on simple normalization, quality control and data transformations. Also provides some helper functions to assist development of other packages.

Inne pakiety związane z r-bioc-scuttle

• dep: libc6 (>= 2.11) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.11) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie alpha, hppa, ia64, riscv64, sh4, sparc64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: liblapack3

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  lub liblapack.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 11) [x32]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, sh4]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  Pakiet niedostępny

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

  Pakiet niedostępny

• dep: r-api-bioc-3.20 [nie hppa, ia64, sh4, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2) [x32]

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-beachmat

  I/O for several formats storing matrix data

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-delayedarray

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-delayedmatrixstats [hppa, ia64, sh4, x32]

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

• dep: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-matrixgenerics [nie hppa, ia64, sh4, x32]

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

• dep: r-bioc-s4arrays [nie hppa, ia64, sh4, x32]

  foundation of array-like containers in Bioconductor

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-singlecellexperiment

  S4 Classes for Single Cell Data

• dep: r-bioc-sparsearray [nie hppa, ia64, sh4, x32]

  efficient in-memory representation of multidimensional sparse arrays

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• dep: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-delayedmatrixstats [nie hppa, ia64, sh4, x32]

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

• sug: r-bioc-scran

  BioConductor methods for single-cell RNA-Seq data analysis

• sug: r-bioc-scrnaseq

  Collection of Public Single-Cell RNA-Seq Datasets

• sug: r-bioc-sparsematrixstats [nie hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor summary statistics for rows and columns of sparse matrices

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Pobieranie r-bioc-scuttle

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.16.0+dfsg-3	428,8 KiB	874,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.16.0+dfsg-3	439,2 KiB	809,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.16.0+dfsg-3	424,6 KiB	810,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.12.0+dfsg-1	415,5 KiB	830,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.12.0+dfsg-1	427,9 KiB	1 043,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1.16.0+dfsg-3	427,7 KiB	808,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.16.0+dfsg-3	422,6 KiB	917,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.16.0+dfsg-3	437,5 KiB	941,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.16.0+dfsg-3	434,6 KiB	873,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.16.0+dfsg-3	435,6 KiB	745,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.16.0+dfsg-3	439,2 KiB	833,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.12.0+dfsg-1	428,1 KiB	791,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.16.0+dfsg-3	417,5 KiB	1 520,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.8.4+dfsg-1	409,7 KiB	734,0 KiB	[lista plików]