Paket: r-bioc-scuttle (1.14.0+dfsg-1 und andere)

[ Quellcode: r-bioc-scuttle  ]

BioConductor single-cell RNA-Seq analysis utilities

Provides basic utility functions for performing single-cell analyses, focusing on simple normalization, quality control and data transformations. Also provides some helper functions to assist development of other packages.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-scuttle

• dep: libblas3 [sparc64]

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.11) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.11) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht alpha, hppa, ia64, riscv64, sh4, sparc64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgfortran5 (>= 8) [sparc64]

  Laufzeitbibliothek für GNU-Fortran-Anwendungen

• dep: liblapack3

  Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

  oder liblapack.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 11) [x32]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, sh4]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: r-api-4.0

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-bioc-3.19 [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2) [x32]

  GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

• dep: r-bioc-beachmat [hppa, ia64, sh4, x32]

  I/O for several formats storing matrix data

  dep: r-bioc-beachmat (>= 2.20.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-biocgenerics [hppa, ia64, sh4, x32]

  generic functions for Bioconductor

  dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-biocparallel [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor facilities for parallel evaluation

  dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-delayedarray [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor delayed operations on array-like objects

  dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.30.1) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-delayedmatrixstats [hppa, ia64, sh4, x32]

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

  dep: r-bioc-delayedmatrixstats (>= 1.26.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-genomicranges [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

  dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-s4vectors [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

  dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-singlecellexperiment [hppa, ia64, sh4, x32]

  S4 Classes for Single Cell Data

  dep: r-bioc-singlecellexperiment (>= 1.26.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-summarizedexperiment [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor assay container

  dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-cran-matrix

  GNU R - Paket von Klassen für dicht und dünn besetzte Matrizen

• dep: r-cran-rcpp

  GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++

• sug: r-bioc-biocstyle [hppa, ia64, sh4, x32]

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

  sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• sug: r-bioc-scran [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor methods for single-cell RNA-Seq data analysis

  sug: r-bioc-scran (>= 1.32.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• sug: r-bioc-scrnaseq [hppa, ia64, sh4, x32]

  Collection of Public Single-Cell RNA-Seq Datasets

  sug: r-bioc-scrnaseq (>= 2.18.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

r-bioc-scuttle herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.14.0+dfsg-1	424,3 kB	868,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.14.0+dfsg-1	434,3 kB	803,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.14.0+dfsg-1	419,7 kB	804,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.12.0+dfsg-1	415,5 kB	830,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.12.0+dfsg-1	427,9 kB	1.043,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.14.0+dfsg-1	417,6 kB	911,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.14.0+dfsg-1	432,1 kB	935,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.14.0+dfsg-1	429,7 kB	867,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.14.0+dfsg-1	430,6 kB	739,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.14.0+dfsg-1	434,0 kB	827,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.12.0+dfsg-1	428,1 kB	791,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.14.0+dfsg-1	412,3 kB	1.514,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.8.4+dfsg-1	409,7 kB	734,0 kB	[Liste der Dateien]