パッケージ: r-bioc-scuttle (1.16.0+dfsg-3 など)

[ ソース: r-bioc-scuttle  ]

BioConductor single-cell RNA-Seq analysis utilities

Provides basic utility functions for performing single-cell analyses, focusing on simple normalization, quality control and data transformations. Also provides some helper functions to assist development of other packages.

その他の r-bioc-scuttle 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.11) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.11) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha, hppa, ia64, riscv64, sh4, sparc64 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: liblapack3

  線形代数ルーチンライブラリ 3 - 共有ライブラリ版

  または liblapack.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 11) [x32]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, sh4]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [hppa, ia64, sh4, x32 以外]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: r-api-4.0

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  パッケージは利用できません

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

  パッケージは利用できません

• dep: r-api-bioc-3.20 [hppa, ia64, sh4, x32 以外]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2) [x32]

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-beachmat

  I/O for several formats storing matrix data

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-delayedarray

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-delayedmatrixstats [hppa, ia64, sh4, x32]

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

• dep: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-matrixgenerics [hppa, ia64, sh4, x32 以外]

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

• dep: r-bioc-s4arrays [hppa, ia64, sh4, x32 以外]

  foundation of array-like containers in Bioconductor

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-singlecellexperiment

  S4 Classes for Single Cell Data

• dep: r-bioc-sparsearray [hppa, ia64, sh4, x32 以外]

  efficient in-memory representation of multidimensional sparse arrays

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• dep: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-delayedmatrixstats [hppa, ia64, sh4, x32 以外]

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

• sug: r-bioc-scran

  BioConductor methods for single-cell RNA-Seq data analysis

• sug: r-bioc-scrnaseq

  Collection of Public Single-Cell RNA-Seq Datasets

• sug: r-bioc-sparsematrixstats [hppa, ia64, sh4, x32 以外]

  BioConductor summary statistics for rows and columns of sparse matrices

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

r-bioc-scuttle のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.16.0+dfsg-3	428.8 kB	874.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.16.0+dfsg-3	439.2 kB	809.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.16.0+dfsg-3	424.6 kB	810.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.12.0+dfsg-1	415.5 kB	830.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.12.0+dfsg-1	427.9 kB	1,043.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	1.16.0+dfsg-3	427.7 kB	808.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.16.0+dfsg-3	422.6 kB	917.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.16.0+dfsg-3	437.5 kB	941.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.16.0+dfsg-3	434.6 kB	873.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.16.0+dfsg-3	435.6 kB	745.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.16.0+dfsg-3	439.2 kB	833.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.12.0+dfsg-1	428.1 kB	791.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.16.0+dfsg-3	417.5 kB	1,520.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.8.4+dfsg-1	409.7 kB	734.0 kB	[ファイル一覧]