Pakiet: libfastahack-dev (1.0.0+dfsg-11 i inne)

[ Pakiet źródłowy: libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (devel)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This is the development package containing the statically linked library and the header files.

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Biblioteki, Rola: Biblioteka deweloperska

Inne pakiety związane z libfastahack-dev

• dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11) [ia64]

  library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

  dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b1) [alpha, hppa, loong64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b2) [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x]

Pobieranie libfastahack-dev

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	28,5 KiB	164,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b2	27,2 KiB	117,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b2	25,5 KiB	114,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.0+dfsg-11+b2	26,6 KiB	105,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b2	26,5 KiB	92,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	27,1 KiB	96,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.0+dfsg-11+b2	28,8 KiB	102,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11	33,3 KiB	165,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	106,8 KiB	1 190,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	26,6 KiB	101,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b2	28,7 KiB	136,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	27,1 KiB	121,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b2	27,3 KiB	119,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b2	78,2 KiB	697,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b2	26,9 KiB	117,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	29,5 KiB	94,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	23,1 KiB	108,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	27,4 KiB	99,0 KiB	[lista plików]