Пакет: libfastahack-dev (1.0.0+dfsg-11 и другие)

[ Источник: libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (devel)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This is the development package containing the statically linked library and the header files.

Теги: Разработка программного обеспечения: Библиотеки, Роль: Библиотека разработчика

Другие пакеты, относящиеся к libfastahack-dev

• dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11) [alpha, ia64, sh4]

  library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

  dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b1) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]

  dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b2) [не alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

Загрузка libfastahack-dev

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.0.0+dfsg-11	29,4 Кб	170,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b2	27,2 Кб	117,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b2	25,5 Кб	114,0 Кб	[список файлов]
armel	1.0.0+dfsg-11+b2	26,6 Кб	105,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b2	26,5 Кб	92,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.0.0+dfsg-11+b1	27,1 Кб	96,0 Кб	[список файлов]
i386	1.0.0+dfsg-11+b2	28,8 Кб	102,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.0.0+dfsg-11	33,3 Кб	165,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.0.0+dfsg-11+b1	26,6 Кб	101,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b2	28,7 Кб	136,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.0.0+dfsg-11+b1	27,1 Кб	121,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b2	27,3 Кб	119,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b2	78,2 Кб	697,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b2	26,9 Кб	117,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.0.0+dfsg-11	29,9 Кб	97,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.0.0+dfsg-11+b1	23,1 Кб	108,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.0.0+dfsg-11+b1	27,4 Кб	99,0 Кб	[список файлов]