Pakiet: boxshade (3.3.1-14 i inne)

[ Pakiet źródłowy: boxshade  ]

Pretty-printing of multiple sequence alignments

Boxshade is a program for creating good looking printouts from multiple-aligned protein or DNA sequences. The program does not perform the alignment by itself and requires as input a file that was created by a multiple alignment program or manually edited with respective tools.

Boxshade reads multiple-aligned sequences from either PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data and ESEE-save files (limited to a maximum of 150 sequences with up to 10000 elements each). Various kinds of shading can be applied to identical/similar residues. Output is written to screen or to a file in the following formats: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: scope::utility, use::typesetting, Obsługa formatu: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika, Tekst

Inne pakiety związane z boxshade

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• sug: kalign

  Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

  lub clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

  lub mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

  lub hmmer

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

• sug: xfig

  Narzędzie do interaktywnego tworzenia rysunków w środowisku X11

Pobieranie boxshade

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	3.3.1-14	57,3 KiB	185,0 KiB	[lista plików]
amd64	3.3.1-14	54,5 KiB	161,0 KiB	[lista plików]
arm64	3.3.1-14+b1	50,4 KiB	192,0 KiB	[lista plików]
armel	3.3.1-14	54,6 KiB	163,0 KiB	[lista plików]
armhf	3.3.1-14	52,9 KiB	135,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	3.3.1-14	52,0 KiB	157,0 KiB	[lista plików]
i386	3.3.1-14	56,0 KiB	176,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	3.3.1-14	68,1 KiB	277,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	3.3.1-14	53,0 KiB	167,0 KiB	[lista plików]
mips64el	3.3.1-14	53,3 KiB	187,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	3.3.1-14	56,1 KiB	193,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3.3.1-14	56,4 KiB	193,0 KiB	[lista plików]
riscv64	3.3.1-14+b2	52,7 KiB	152,0 KiB	[lista plików]
s390x	3.3.1-14	52,9 KiB	168,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	3.3.1-14	60,8 KiB	156,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	3.3.1-14	50,4 KiB	170,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	3.3.1-14	54,4 KiB	160,0 KiB	[lista plików]