Pakiet: boxshade (3.3.1-12)

[ Pakiet źródłowy: boxshade  ]

Pretty-printing of multiple sequence alignments

Boxshade is a program for creating good looking printouts from multiple-aligned protein or DNA sequences. The program does not perform the alignment by itself and requires as input a file that was created by a multiple alignment program or manually edited with respective tools.

Boxshade reads multiple-aligned sequences from either PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data and ESEE-save files (limited to a maximum of 150 sequences with up to 10000 elements each). Various kinds of shading can be applied to identical/similar residues. Output is written to screen or to a file in the following formats: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: scope::utility, use::typesetting, Obsługa formatu: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika, Tekst

Inne pakiety związane z boxshade

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• sug: kalign

  Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

  lub clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

  lub mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

  lub hmmer

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

• sug: xfig

  Narzędzie do interaktywnego tworzenia rysunków w środowisku X11

Pobieranie boxshade

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	54,0 KiB	161,0 KiB	[lista plików]
arm64	53,2 KiB	164,0 KiB	[lista plików]
armhf	51,6 KiB	135,0 KiB	[lista plików]
i386	55,8 KiB	168,0 KiB	[lista plików]