パッケージ: tombo (1.5.1-4 など)

[ ソース: tombo  ]

identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data

Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.

その他の tombo 関連パッケージ

• dep: cython3

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-pkg-resources

  pkg_resources を用いたパッケージ検索およびリソースアクセス

• dep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

tombo のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1.5.1-4+b1	418.2 kB	1,419.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.5.1-4+b1	408.3 kB	1,430.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.5.1-4+b1	411.0 kB	1,382.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.5.1-4+b1	412.1 kB	1,322.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.5.1-4+b1	423.6 kB	1,435.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.5.1-4+b1	405.6 kB	1,499.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	1.5.1-4+b1	412.4 kB	1,426.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.5.1-4+b1	417.9 kB	1,494.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.5.1-4+b1	406.3 kB	1,410.0 kB	[ファイル一覧]