[ ソース: provean ]
パッケージ: provean (1.1.5+ds-3)
provean に関するリンク
Debian の資源:
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メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [provean.jcvi.org]
類似のパッケージ:
Protein Variation Effect Analyzer
PROVEAN (Protein Variation Effect Analyzer) is a software tool which predicts whether an amino acid substitution or indel has an impact on the biological function of a protein.
PROVEAN is useful for filtering sequence variants to identify nonsynonymous or indel variants that are predicted to be functionally important.
The performance of PROVEAN is comparable to popular tools such as SIFT or PolyPhen-2.
A fast computation approach to obtain pairwise sequence alignment scores enabled the generation of precomputed PROVEAN predictions for 20 single AA substitutions and a single AA deletion at every amino acid position of all protein sequences in human and mouse.
その他の provean 関連パッケージ
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- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
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- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, riscv64 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
provean のダウンロード
| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| amd64 | 51.0 kB | 149.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 44.7 kB | 153.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 45.4 kB | 152.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 47.3 kB | 152.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 52.2 kB | 144.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 49.5 kB | 222.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 49.2 kB | 153.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 48.1 kB | 113.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 50.3 kB | 141.0 kB | [ファイル一覧] |