Пакет: provean (1.1.5+ds-3)

[ Източник: provean  ]

Protein Variation Effect Analyzer

PROVEAN (Protein Variation Effect Analyzer) is a software tool which predicts whether an amino acid substitution or indel has an impact on the biological function of a protein.

PROVEAN is useful for filtering sequence variants to identify nonsynonymous or indel variants that are predicted to be functionally important.

The performance of PROVEAN is comparable to popular tools such as SIFT or PolyPhen-2.

A fast computation approach to obtain pairwise sequence alignment scores enabled the generation of precomputed PROVEAN predictions for 20 single AA substitutions and a single AA deletion at every amino acid position of all protein sequences in human and mouse.

Други пакети, свързани с provean

• dep: cd-hit

  suite of programs designed to quickly group sequences

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, riscv64]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Изтегляне на provean

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	51,0 кБ	149,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	44,7 кБ	153,0 кБ	[списък на файловете]
armel	45,4 кБ	152,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	47,3 кБ	152,0 кБ	[списък на файловете]
i386	52,2 кБ	144,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	49,5 кБ	222,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	49,2 кБ	153,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	48,1 кБ	113,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	50,3 кБ	141,0 кБ	[списък на файловете]