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ソースパッケージ: unicycler (0.5.1+dfsg-2)

unicycler に関するリンク

警告: このパッケージは experimental ディストリビューションのものです。つまり、おそらく不安定でバグがあり、それどころかデータの損失を起こすかもしれません。使用前には、変更履歴やその他の参照可能なドキュメントを必ず調べてください。

以下のバイナリパッケージがこのソースパッケージからビルドされています。

unicycler: hybrid assembly pipeline for bacterial genomes
unicycler-data: hybrid assembly pipeline for bacterial genomes (data package)

構築依存	構築依存 (アーキテクチャ非依存)

adep: debhelper-compat (= 13)

パッケージは利用できません
adep: dh-sequence-python3

以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: dh-python
adep: python3-all

package depending on all supported Python 3 runtime versions
adep: python3-setuptools

Python3 用配布用ユーティリティへの機能強化
adep: default-jdk

Standard Java or Java compatible Development Kit
adep: bcftools

ゲノムの variant call と VCF/BCF ファイルの操作
adep: bowtie2

ultrafast memory-efficient short read aligner
adep: miniasm

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads
adep: ncbi-blast+

next generation suite of BLAST sequence search tools
adep: pilon

automated genome assembly improvement and variant detection tool
adep: racon

consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads
adep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
adep: spades (>= 3.14)

genome assembler for single-cell and isolates data sets
adep: libseqan2-dev (= 2.5.0~rc3+dfsg-1)

C++ library for the analysis of biological sequences (development)
adep: zlib1g-dev

圧縮ライブラリ - 開発キット

Debian パッケージソースリポジトリ (VCS: Git): https://salsa.debian.org/med-team/unicycler.git
Debian パッケージソースリポジトリ (ブラウザで表示可能): https://salsa.debian.org/med-team/unicycler