Tarkennettu haku
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]

Source Package: unicycler (0.5.1+dfsg-2)

Links for unicycler

Debian-palvelut:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kokeellinen paketti

Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.

Seuraavat binääripaketit on käännetty tästä lähdepaketista:
unicycler
hybrid assembly pipeline for bacterial genomes
unicycler-data
hybrid assembly pipeline for bacterial genomes (data package)

Muut pakettiin unicycler liittyvät paketit

  • build-depends
  • build-depends-indep
  • adep: debhelper-compat (= 13)
    Paketti ei saatavilla
  • adep: dh-sequence-python3
    näennäispaketti, jonka toteuttaa dh-python
  • adep: python3-all
    package depending on all supported Python 3 runtime versions
  • adep: python3-setuptools
    Python3 Distutils Enhancements
  • adep: default-jdk
    Standard Java or Java compatible Development Kit
  • adep: bcftools
    genomic variant calling and manipulation of VCF/BCF files
  • adep: bowtie2
    ultrafast memory-efficient short read aligner
  • adep: miniasm
    ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads
  • adep: ncbi-blast+
    next generation suite of BLAST sequence search tools
  • adep: pilon
    automated genome assembly improvement and variant detection tool
  • adep: racon
    consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads
  • adep: samtools
    processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
  • adep: spades (>= 3.14)
    genome assembler for single-cell and isolates data sets
  • adep: libseqan2-dev (= 2.5.0~rc3+dfsg-1)
    C++ library for the analysis of biological sequences (development)
  • adep: zlib1g-dev
    compression library - development

Download unicycler

TiedostoKoko (kt)MD5-tarkiste
unicycler_0.5.1+dfsg-2.dsc 2.4 kt 057d2aa9ac92afd76a1af0bd18612cfe
unicycler_0.5.1+dfsg.orig.tar.xz 14,425.0 kt 22bef237ad14fd5fa44602f232e75a20
unicycler_0.5.1+dfsg-2.debian.tar.xz 13.0 kt 3d89418844b9734d1b36f8f5266ce414
Debian Package Source Repository (VCS: Git)
https://salsa.debian.org/med-team/unicycler.git
Debian Package Source Repository (Browsable)
https://salsa.debian.org/med-team/unicycler