Pakiet źródłowy: unicycler (0.5.1+dfsg-2)
Odnośniki dla unicycler
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Repozytorium kodu źródłowego Debiana (Git)
- Śledzenie łatek systemu Debian
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Andreas Tille (Strona QA)
- Liubov Chuprikova (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Pakiet eksperymentalny
Ostrzeżenie: Pakiet pochodzi z dystrybucji eksperymentalnej. Oznacza to, że prawdopodobnie jest niestabilny lub zawiera błędy i może spowodować nawet utratę danych. Przed użyciem pakietu proszę koniecznie zapoznać się z dziennikiem zmian i inną dostępną dokumentacją.
Z tego pakietu źródłowego zbudowano następujące pakiety binarne:
- unicycler
- hybrid assembly pipeline for bacterial genomes
- unicycler-data
- hybrid assembly pipeline for bacterial genomes (data package)
Inne pakiety związane z unicycler
|
|
-
- adep: debhelper-compat (= 13)
- Pakiet niedostępny
-
- adep: dh-sequence-python3
- pakiet wirtualny udostępniany przez dh-python
-
- adep: python3-all
- package depending on all supported Python 3 runtime versions
-
- adep: python3-setuptools
- Python3 Distutils Enhancements
-
- adep: default-jdk
- Standard Java or Java compatible Development Kit
-
- adep: bcftools
- Wywoływanie wariantów genomowych oraz zarządzanie plikami VCF i BCF
-
- adep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- adep: miniasm
- ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads
-
- adep: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- adep: pilon
- automated genome assembly improvement and variant detection tool
-
- adep: racon
- consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads
-
- adep: samtools
- Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
-
- adep: spades (>= 3.14)
- genome assembler for single-cell and isolates data sets
-
- adep: libseqan2-dev (= 2.5.0~rc3+dfsg-1)
- C++ library for the analysis of biological sequences (development)
-
- adep: zlib1g-dev
- Biblioteka do kompresji danych - pliki deweloperskie
Download unicycler
Plik | Rozmiar (w KiB) | Suma kontrolna MD5 |
---|---|---|
unicycler_0.5.1+dfsg-2.dsc | 2,4 KiB | 057d2aa9ac92afd76a1af0bd18612cfe |
unicycler_0.5.1+dfsg.orig.tar.xz | 14 425,0 KiB | 22bef237ad14fd5fa44602f232e75a20 |
unicycler_0.5.1+dfsg-2.debian.tar.xz | 13,0 KiB | 3d89418844b9734d1b36f8f5266ce414 |
- Repozytorium kodu źródłowego Debiana (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/unicycler.git
- Repozytorium kodu źródłowego Debiana (do przeglądania)
- https://salsa.debian.org/med-team/unicycler