Paquet source : unicycler (0.5.1+dfsg-2)
Liens pour unicycler
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Dépôt de source Debian (Git)
- Suivis des correctifs pour Debian
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille (Page QA)
- Liubov Chuprikova (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquet « expérimental »
Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale
. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog
) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- unicycler
- pipeline d’assemblage hybride pour des génomes bactériens
- unicycler-data
- hybrid assembly pipeline for bacterial genomes (data package)
Autres paquets associés à unicycler
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- adep: debhelper-compat (= 13)
- Paquet indisponible
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- adep: dh-sequence-python3
- paquet virtuel fourni par dh-python
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- adep: python3-all
- package depending on all supported Python 3 runtime versions
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- adep: python3-setuptools
- Améliorations de Python3 Distutils
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- adep: default-jdk
- Standard Java or Java compatible Development Kit
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- adep: bcftools
- appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF
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- adep: bowtie2
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
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- adep: miniasm
- assembleur de novo très rapide pour des lectures longues de séquences d’ADN bruitées
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- adep: ncbi-blast+
- suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération
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- adep: pilon
- automated genome assembly improvement and variant detection tool
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- adep: racon
- consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads
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- adep: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
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- adep: spades (>= 3.14)
- assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »
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- adep: libseqan2-dev (= 2.5.0~rc3+dfsg-1)
- C++ library for the analysis of biological sequences (development)
-
- adep: zlib1g-dev
- bibliothèque de compression — paquet de développement
Download unicycler
| Fichier | Taille (en ko) | Somme MD5 |
|---|---|---|
| unicycler_0.5.1+dfsg-2.dsc | 2,4 ko | 057d2aa9ac92afd76a1af0bd18612cfe |
| unicycler_0.5.1+dfsg.orig.tar.xz | 14 425,0 ko | 22bef237ad14fd5fa44602f232e75a20 |
| unicycler_0.5.1+dfsg-2.debian.tar.xz | 13,0 ko | 3d89418844b9734d1b36f8f5266ce414 |
- Dépôt Debian des paquets source (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/unicycler.git
- Dépôt Debian des paquets source (interface web)
- https://salsa.debian.org/med-team/unicycler