パッケージ: unikmer (0.20.0-1 など)

[ ソース: unikmer  ]

Toolkit for nucleic acid k-mer analysis

unikmer is a golang package and a toolkit for nucleic acid k-mer analysis, providing functions including set operation k-mers optional with TaxIDs but without count information.

K-mers are either encoded (k<=32) or hashed (arbitrary k) into uint64, and serialized in binary file with extension .unik.

TaxIDs can be assigned when counting k-mers from genome sequences, and LCA (Lowest Common Ancestor) is computed during set opertions including computing union, intersecton, set difference, unique and repeated k-mers.

その他の unikmer 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [loong64 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

unikmer のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	0.20.0-1+b7	3,109.8 kB	10,108.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.20.0-1+b7	2,650.7 kB	9,516.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.20.0-1+b7	2,749.3 kB	9,678.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.20.0-1+b7	2,740.7 kB	9,678.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.20.0-1+b7	2,982.2 kB	9,691.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	0.20.0-1+b4	2,566.0 kB	9,430.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.20.0-1+b7	2,489.0 kB	11,071.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.20.0-1+b7	2,641.1 kB	9,900.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.20.0-1+b7	2,757.3 kB	9,643.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.20.0-1+b7	2,819.9 kB	10,668.0 kB	[ファイル一覧]