Paquet : unikmer (0.20.0-1 et autres)

[ Paquet source : unikmer  ]

Toolkit for nucleic acid k-mer analysis

unikmer is a golang package and a toolkit for nucleic acid k-mer analysis, providing functions including set operation k-mers optional with TaxIDs but without count information.

K-mers are either encoded (k<=32) or hashed (arbitrary k) into uint64, and serialized in binary file with extension .unik.

TaxIDs can be assigned when counting k-mers from genome sequences, and LCA (Lowest Common Ancestor) is computed during set opertions including computing union, intersecton, set difference, unique and repeated k-mers.

Autres paquets associés à unikmer

• dep: libc6 (>= 2.34) [non loong64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

Télécharger unikmer

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	0.20.0-1+b7	3 109,8 ko	10 108,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.20.0-1+b7	2 650,7 ko	9 516,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.20.0-1+b7	2 749,3 ko	9 678,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.20.0-1+b7	2 740,7 ko	9 678,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.20.0-1+b7	2 982,2 ko	9 691,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	0.20.0-1+b4	2 566,0 ko	9 430,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.20.0-1+b7	2 489,0 ko	11 071,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.20.0-1+b7	2 641,1 ko	9 900,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.20.0-1+b7	2 757,3 ko	9 643,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.20.0-1+b7	2 819,9 ko	10 668,0 ko	[liste des fichiers]