パッケージ: unikmer (0.20.0-1 など)

[ ソース: unikmer  ]

Toolkit for nucleic acid k-mer analysis

unikmer is a golang package and a toolkit for nucleic acid k-mer analysis, providing functions including set operation k-mers optional with TaxIDs but without count information.

K-mers are either encoded (k<=32) or hashed (arbitrary k) into uint64, and serialized in binary file with extension .unik.

TaxIDs can be assigned when counting k-mers from genome sequences, and LCA (Lowest Common Ancestor) is computed during set opertions including computing union, intersecton, set difference, unique and repeated k-mers.

その他の unikmer 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

unikmer のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	0.20.0-1+b4	3,000.8 kB	9,598.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.20.0-1+b4	2,575.1 kB	9,174.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.20.0-1+b4	2,571.2 kB	9,145.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.20.0-1+b4	2,562.1 kB	9,145.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.20.0-1+b4	2,813.5 kB	9,190.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.20.0-1+b4	2,319.7 kB	10,473.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.20.0-1+b4	2,562.1 kB	9,428.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.20.0-1+b4	2,580.9 kB	9,109.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.20.0-1+b4	2,731.2 kB	10,197.0 kB	[ファイル一覧]