パッケージ: ntcard (1.2.2+dfsg-9 など)

[ ソース: ntcard  ]

Streaming algorithm to estimate cardinality in genomics datasets

As input it takes file(s) in fasta, fastq, sam, or bam formats and computes the total number of distinct k-mers, F0, and also the k-mer coverage frequency histogram, fi, i>=1.

その他の ntcard 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [hppa, m68k, x32]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32 以外]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 11) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32 以外]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

ntcard のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.2.2+dfsg-9	38.3 kB	219.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.2.2+dfsg-9	41.2 kB	170.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.2.2+dfsg-9	39.1 kB	218.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.2.2+dfsg-4	41.3 kB	139.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.2.2+dfsg-4	47.4 kB	230.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.2.2+dfsg-4	39.8 kB	143.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.2.2+dfsg-9	41.0 kB	223.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.2.2+dfsg-9	42.6 kB	282.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.2.2+dfsg-9	42.8 kB	218.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.2.2+dfsg-9	40.2 kB	146.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.2.2+dfsg-9	41.1 kB	170.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.2.2+dfsg-4	43.7 kB	217.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.2.2+dfsg-9	37.3 kB	2,080.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.2.2+dfsg-4	39.2 kB	143.0 kB	[ファイル一覧]