Paket: ntcard (1.2.2+dfsg-9 och andra)

[ Källkod: ntcard  ]

Streaming algorithm to estimate cardinality in genomics datasets

As input it takes file(s) in fasta, fastq, sam, or bam formats and computes the total number of distinct k-mers, F0, and also the k-mer coverage frequency histogram, fi, i>=1.

Andra paket besläktade med ntcard

• dep: libc6 (>= 2.34) [hppa, m68k, x32]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [ej alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GNU standardbibliotek v3 för C++

  dep: libstdc++6 (>= 14) [ej hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Hämta ntcard

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.2.2+dfsg-9	38,3 kbyte	219,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.2.2+dfsg-9	41,2 kbyte	170,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.2.2+dfsg-9	39,1 kbyte	218,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1.2.2+dfsg-4	41,3 kbyte	139,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.2.2+dfsg-4	47,4 kbyte	230,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.2.2+dfsg-4	39,8 kbyte	143,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.2.2+dfsg-9	41,0 kbyte	223,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.2.2+dfsg-9	42,6 kbyte	282,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.2.2+dfsg-9	42,8 kbyte	218,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.2.2+dfsg-9	40,2 kbyte	146,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.2.2+dfsg-9	41,1 kbyte	170,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.2.2+dfsg-4	43,7 kbyte	217,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.2.2+dfsg-9	37,3 kbyte	2.080,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.2.2+dfsg-4	39,2 kbyte	143,0 kbyte	[filförteckning]