[ ソース: ntcard ]
パッケージ: ntcard (1.2.2+dfsg-9)
Streaming algorithm to estimate cardinality in genomics datasets
As input it takes file(s) in fasta, fastq, sam, or bam formats and computes the total number of distinct k-mers, F0, and also the k-mer coverage frequency histogram, fi, i>=1.
その他の ntcard 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3