Paquet : ntcard (1.2.2+dfsg-9 et autres)

[ Paquet source : ntcard  ]

Streaming algorithm to estimate cardinality in genomics datasets

As input it takes file(s) in fasta, fastq, sam, or bam formats and computes the total number of distinct k-mers, F0, and also the k-mer coverage frequency histogram, fi, i>=1.

Autres paquets associés à ntcard

• dep: libc6 (>= 2.34) [hppa, m68k, x32]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

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Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.2.2+dfsg-9	38,3 ko	219,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.2.2+dfsg-9	41,2 ko	170,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.2.2+dfsg-9	39,1 ko	218,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.2.2+dfsg-4	41,3 ko	139,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.2.2+dfsg-4	47,4 ko	230,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.2.2+dfsg-4	39,8 ko	143,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.2.2+dfsg-9	41,0 ko	223,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.2.2+dfsg-9	42,6 ko	282,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.2.2+dfsg-9	42,8 ko	218,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.2.2+dfsg-9	40,2 ko	146,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.2.2+dfsg-9	41,1 ko	170,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.2.2+dfsg-4	43,7 ko	217,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.2.2+dfsg-9	37,3 ko	2 080,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.2.2+dfsg-4	39,2 ko	143,0 ko	[liste des fichiers]