Paketti: ntcard (1.2.2+dfsg-9 ja muut)

[ Source: ntcard  ]

Streaming algorithm to estimate cardinality in genomics datasets

As input it takes file(s) in fasta, fastq, sam, or bam formats and computes the total number of distinct k-mers, F0, and also the k-mer coverage frequency histogram, fi, i>=1.

Muut pakettiin ntcard liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [hppa, m68k, x32]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [ei hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Imuroi ntcard

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.2.2+dfsg-9	38.3 kt	219.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.2.2+dfsg-9	41.2 kt	170.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.2.2+dfsg-9	39.1 kt	218.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.2.2+dfsg-4	41.3 kt	139.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.2.2+dfsg-4	47.4 kt	230.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.2.2+dfsg-4	39.8 kt	143.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.2.2+dfsg-9	41.0 kt	223.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.2.2+dfsg-9	42.6 kt	282.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.2.2+dfsg-9	42.8 kt	218.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.2.2+dfsg-9	40.2 kt	146.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.2.2+dfsg-9	41.1 kt	170.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.2.2+dfsg-4	43.7 kt	217.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.2.2+dfsg-9	37.3 kt	2,080.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.2.2+dfsg-4	39.2 kt	143.0 kt	[tiedostoluettelo]