Balík: freebayes (1.3.7-1~exp a iné)

[ Zdroj: freebayes  ]

Experimentálny balík

Upozornenie: Tento balík pochádza z distribúcie experimental. To znamená, že je pravdepodobne nestabilný alebo môže dokonca spôsobiť stratu údajov. Predtým, než ho začnete používať sa prosím pozrite do záznamu zmien a ďalšej možnej dokumentácie.

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom freebayes

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [nie amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [nie amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

  dep: libvcflib1 (>= 1.0.9+dfsg) [riscv64]

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• rec: parallel

  príprava a paralelné spúšťanie príkazových riadkov zo štandardného vstupu

Stiahnuť freebayes

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1.3.7-1~exp+b1	1,453.0 kB	4,027.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.3.7-1~exp+b1	1,397.1 kB	3,922.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.3.7-1~exp	1,378.4 kB	3,821.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.3.7-1~exp	1,386.2 kB	3,445.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.3.7-1~exp	1,502.3 kB	4,185.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.3.7-1~exp+b1	1,573.9 kB	5,599.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.3.7-1~exp+b1	1,404.1 kB	3,930.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.3.7-1~exp+b1	1,428.4 kB	4,378.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.3.7-1~exp+b1	1,455.3 kB	4,498.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.3.7-1~exp+b1	1,473.5 kB	4,307.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64 (neoficiálny port)	1.3.7-1~exp	1,435.6 kB	3,701.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.3.7-1~exp	1,375.9 kB	4,052.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.3.7-1~exp+b1	1,533.1 kB	3,916.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.3.7-1~exp	1,357.1 kB	4,639.0 kB	[zoznam súborov]