パッケージ: boxshade (3.3.1-14)

[ ソース: boxshade  ]

多重配列アライメントのプリティプリンティング

Boxshade はマルチプルアライメントされたタンパク質または DNA 配列のきれいな プリントアウトを生成するプログラムです。このプログラム自身はアライメントを 行いませんので、入力ファイルとして、マルチプルアライメントプログラムが作成 したか、または個々のツールで手動編集したファイルが必要です。

Boxshade はマルチプルアライメントされた配列を PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data および ESEE-save ファイルから読み込みます (最大 150 配列 まで、各配列は最大 10000 エレメントまでの制限があります) 。各種シェーディ ングを一致する/類似の残基に適用できます。出力は画面に表示するか、または以下の フォーマットによりファイルに出力できます: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ-250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, use::typesetting, サポート形式: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, 取り扱い対象: 追加のタグが必要, テキスト

その他の boxshade 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• sug: kalign

  グローバルおよびプログレッシブ多重配列アライメント

  または clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

  または mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

  または hmmer

  タンパク質配列解析用のプロファイル隠れマルコフモデル

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

• sug: xfig

  Facility for Interactive Generation of figures under X11

boxshade のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
mips64el	53.3 kB	187.0 kB	[ファイル一覧]