Пакет: flexbar (1:3.5.0-5 и другие)

[ Источник: flexbar  ]

flexible barcode and adapter removal for sequencing platforms

Flexbar preprocesses high-throughput sequencing data efficiently. It demultiplexes barcoded runs and removes adapter sequences. Moreover, trimming and filtering features are provided. Flexbar increases mapping rates and improves genome and transcriptome assemblies. It supports next-generation sequencing data in fasta/q and csfasta/q format from Illumina, Roche 454, and the SOLiD platform.

Parameter names changed in Flexbar. Please review scripts. The recent months, default settings were optimised, several bugs were fixed and various improvements were made, e.g. revamped command-line interface, new trimming modes as well as lower time and memory requirements.

Другие пакеты, относящиеся к flexbar

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.34) [не arm64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, i386, riscv64]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 12) [не arm64, riscv64]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

• dep: libtbb12 (>= 2021.11.0) [riscv64]

  parallelism library for C++ - runtime files

  dep: libtbb12 (>= 2021.12.0) [arm64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.4.0) [amd64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.8.0) [не amd64, arm64, riscv64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка flexbar

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1:3.5.0-5	347,6 Кб	1 165,0 Кб	[список файлов]
arm64	1:3.5.0-5+b1	317,7 Кб	1 214,0 Кб	[список файлов]
armel	1:3.5.0-5	288,9 Кб	1 040,0 Кб	[список файлов]
armhf	1:3.5.0-5	299,0 Кб	820,0 Кб	[список файлов]
i386	1:3.5.0-5	353,1 Кб	1 184,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1:3.5.0-5	285,8 Кб	1 321,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1:3.5.0-5	336,8 Кб	1 341,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1:3.5.0-5+b1	342,7 Кб	998,0 Кб	[список файлов]
s390x	1:3.5.0-5	302,9 Кб	1 185,0 Кб	[список файлов]