Package: tree-puzzle (5.3~rc16+dfsg-11 and others)

[ Source: tree-puzzle  ]

ricostruzione di alberi filogenetici con il metodo della massima verosimiglianza

TREE-PUZZLE (nuovo nome di PUZZLE) è un programma interattivo per console che implementa un veloce algoritmo di ricerca di alberi chiamato "quartet puzzling" che permette l'analisi di grandi insiemi di dati e che assegna automaticamente stime di verosimiglianza per ciascun ramo interno. TREE-PUZZLE calcola anche la massima distanza verosimile per coppie di elementi, nonché la lunghezza di rami per alberi specificati dall'utente. Le lunghezze dei rami possono anche essere calcolate in base all'ipotesi dell'orologio molecolare. In aggiunta, TREE-PUZZLE offre un metodo nuovo, la mappatura di verosimiglianza, per studiare la verosimiglianza di un ramo interno ipotizzato senza calcolare un albero totale e per visualizzare il contenuto filogenetico di un allineamento di sequenze.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to tree-puzzle

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libsprng2

  libreria SPRNG (Scalable Parallel RNG) -- pacchetto libreria

• rec: tree-puzzle-doc

  ricostruzione di alberi filogenetici con il metodo della massima verosimiglianza (documentazione)

• sug: phylip

  pacchetto di programmi per inferire alberi filogenetici

• sug: treetool

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-11	166.9 kB	492.0 kB	[list of files]
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arm64	5.3~rc16+dfsg-11	152.0 kB	428.0 kB	[list of files]
armel	5.3~rc16+dfsg-11	161.2 kB	411.0 kB	[list of files]
armhf	5.3~rc16+dfsg-11	151.7 kB	303.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-11	158.1 kB	400.0 kB	[list of files]
i386	5.3~rc16+dfsg-11	179.1 kB	491.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	214.9 kB	785.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-11	152.1 kB	411.0 kB	[list of files]
mips64el	5.3~rc16+dfsg-11	165.2 kB	507.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-11	177.8 kB	492.0 kB	[list of files]
ppc64el	5.3~rc16+dfsg-11	175.7 kB	492.0 kB	[list of files]
riscv64	5.3~rc16+dfsg-11	168.8 kB	348.0 kB	[list of files]
s390x	5.3~rc16+dfsg-11	176.7 kB	439.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-11	178.3 kB	364.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-11	153.0 kB	1,069.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	5.3~rc16+dfsg-11	162.5 kB	383.0 kB	[list of files]