软件包：tree-puzzle（5.3~rc16+dfsg-11 以及其他的）

[ 源代码： tree-puzzle  ]

Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood

TREE-PUZZLE (the new name for PUZZLE) is an interactive console program that implements a fast tree search algorithm, quartet puzzling, that allows analysis of large data sets and automatically assigns estimations of support to each internal branch. TREE-PUZZLE also computes pairwise maximum likelihood distances as well as branch lengths for user specified trees. Branch lengths can also be calculated under the clock-assumption. In addition, TREE-PUZZLE offers a novel method, likelihood mapping, to investigate the support of a hypothesized internal branch without computing an overall tree and to visualize the phylogenetic content of a sequence alignment.

标签: 领域: 生物学, 生物信息学, 实做语言: implemented-in::c, interface::commandline, 角色: 程序, 范围: 实用程序, Purpose: use::analysing, use::comparing, 支持的格式: 纯文本, 处理: 需要一个额外的标签

其他与 tree-puzzle 有关的软件包

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  软件包暂时不可用

下载 tree-puzzle

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	5.3~rc16+dfsg-11	166.9 kB	492.0 kB	[文件列表]
amd64	5.3~rc16+dfsg-11	166.0 kB	400.0 kB	[文件列表]
arm64	5.3~rc16+dfsg-11	152.0 kB	428.0 kB	[文件列表]
armel	5.3~rc16+dfsg-11	161.2 kB	411.0 kB	[文件列表]
armhf	5.3~rc16+dfsg-11	151.7 kB	303.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	5.3~rc16+dfsg-11	158.1 kB	400.0 kB	[文件列表]
i386	5.3~rc16+dfsg-11	179.1 kB	491.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	5.3~rc16+dfsg-9+b1	214.9 kB	785.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	5.3~rc16+dfsg-11	152.1 kB	411.0 kB	[文件列表]
mips64el	5.3~rc16+dfsg-11	165.2 kB	507.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	5.3~rc16+dfsg-11	177.8 kB	492.0 kB	[文件列表]
ppc64el	5.3~rc16+dfsg-11	175.7 kB	492.0 kB	[文件列表]
riscv64	5.3~rc16+dfsg-11	168.8 kB	348.0 kB	[文件列表]
s390x	5.3~rc16+dfsg-11	176.7 kB	439.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	5.3~rc16+dfsg-11	178.3 kB	364.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	5.3~rc16+dfsg-11	153.0 kB	1,069.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	5.3~rc16+dfsg-11	162.5 kB	383.0 kB	[文件列表]