Package: python3-rdkit (202503.1-2 and others)

[ Source: rdkit  ]

raccolta di software per chemioinformatica e apprendimento automatico

RDKit è un ambiente software per chemioinformatica e apprendimento automatico basato su Python/C++. Le funzionalità includono:

 * gestione e trasformazione di reazioni chimiche,
 * ricerca di sottostrutture con SMARTS,
 * SMILES canonico,
 * allineamento molecola-molecola,
 * un vasto numero di descrittori molecolari, inclusi topologici, di
   composizione, EState, SlogP/SMR, VSA e vettori Feature-map,
 * frammentazione usando le regole RECAP,
 * generazione e descrizione di coordinate 2D, inclusa descrizione con
   vincoli,
 * generazione di coordinate 3D usando l'incorporazione di geometria,
 * campi di forza UFF e MMFF94,
 * gestione della chiralità, incluso calcolo di codici (R/S) stereochimici,
 * ricerca di farmacofori 2D,
 * impronte digitali, inclusi stile Daylight, di coppie di atomi, torsioni
   topologiche, algoritmo di Morgan e chiavi MACCS,
 * calcolo di similarità di forma,
 * massima sottostruttura comune multimolecola,
 * apprendimento automatico con algoritmi di teoria dell'informazione e
   clustering,
 * calcolo della carica parziale di Gasteiger-Marsili.

I formati di file gestiti da RDKit includono MDL Mol, PDB, SDF, TDT, SMILES e il formato binario di RDKit.

Other Packages Related to python3-rdkit

• dep: fonts-freefont-ttf

  tipi di carattere serif, sans e mono TrueType Freefont

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  libreria Boost.Iostreams

• dep: libboost-numpy1.83.0 (>= 1.83.0) [not hppa, sparc64]

  estensioni NumPy per Boost.Python

• dep: libboost-numpy1.83.0-py312 [m68k, ppc64]

  virtual package provided by libboost-numpy1.83.0

• dep: libboost-numpy1.83.0-py313 [not hppa, m68k, ppc64, sparc64]

  virtual package provided by libboost-numpy1.83.0

• dep: libboost-python1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  libreria Boost.Python

• dep: libboost-python1.74.0-py39 [hppa]

  Package not available

• dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0) [not hppa]

  libreria Boost.Python

• dep: libboost-python1.83.0-py312 [m68k, ppc64, sparc64]

  virtual package provided by libboost-python1.83.0

• dep: libboost-python1.83.0-py313 [not hppa, m68k, ppc64, sparc64]

  virtual package provided by libboost-python1.83.0

• dep: libboost-regex1.83.0-icu72 [sparc64]

  virtual package provided by libboost-regex1.83.0

• dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  libreria di serializzazione per C++

• dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0) [not hppa]

  libreria di serializzazione per C++

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  libreria per accedere al sistema operativo (es. supporto diagnostico)

• dep: libc6 (>= 2.29) [hppa]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [m68k, ppc64, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10) [not hppa]

  libreria Cairo per grafica 2D vettoriale

• dep: libcoordgen3 (>= 3.0.0) [hppa]

  generazione di coordinate 2D per composti chimici

  dep: libcoordgen3 (>= 3.0.2) [not hppa]

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]

  motore per caratteri FreeType 2, libreria condivisa

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not alpha, hppa, m68k, riscv64, sparc64]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libinchi1.07 (>= 1.07.1+dfsg) [sparc64]

  algoritmo InChI (International Chemical Identifier) (libreria)

• dep: libmaeparser1 (>= 1.2.4) [hppa]

  parser for Schrödinger Maestro files

  dep: libmaeparser1 (>= 1.3.1) [sparc64]

• dep: libpython3.12t64 (>= 3.12.1) [sparc64]

  libreria runtime condivisa per Python (versione 3.12)

• dep: libpython3.9 (>= 3.9.1) [hppa]

  Package not available

• dep: librdkit1 [hppa]

  raccolta di software per chemioinformatica e apprendimento automatico (librerie condivise)

• dep: librdkit1t64 (>= 202309.3) [sparc64]

  raccolta di software per chemioinformatica e apprendimento automatico (librerie condivise)

  dep: librdkit1t64 (>= 202409.2) [m68k, ppc64]

  dep: librdkit1t64 (>= 202503.1) [not hppa, m68k, ppc64, sparc64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [not hppa, m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [hppa]

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

  dep: python3 (<< 3.10) [hppa]

  dep: python3 (<< 3.13) [m68k, ppc64, sparc64]

  dep: python3 (<< 3.14) [not hppa, m68k, ppc64, sparc64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [m68k, ppc64, sparc64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [not hppa, m68k, ppc64, sparc64]

  dep: python3 (>= 3.9~) [hppa]

• dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [hppa]

  libreria Python per calcoli numerici (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [m68k, ppc64, sparc64]

• dep: python3-numpy-abi9 [hppa, m68k, ppc64, sparc64]

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [not hppa, m68k, ppc64, sparc64]

  virtual package provided by python3-numpy

  or python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: rdkit-data

  raccolta di software per chemioinformatica e apprendimento automatico (file dei dati)

• sug: rdkit-doc

  raccolta di software per chemioinformatica e apprendimento automatico (documentazione)

Download python3-rdkit

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	202503.1-2	4,373.7 kB	31,007.0 kB	[list of files]
amd64	202503.1-2	4,570.4 kB	27,995.0 kB	[list of files]
arm64	202503.1-2	4,248.9 kB	29,177.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	202009.5-2	3,843.8 kB	24,156.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	202503.1-2	4,368.5 kB	29,106.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	202409.2-2	4,153.6 kB	24,555.0 kB	[list of files]
mips64el	202503.1-2	4,155.3 kB	31,577.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	202409.2-2	4,170.0 kB	32,025.0 kB	[list of files]
ppc64el	202503.1-2	4,395.9 kB	31,734.0 kB	[list of files]
riscv64	202503.1-2	4,485.8 kB	25,151.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	202309.3-6	3,957.3 kB	67,971.0 kB	[list of files]