Paquet : python3-rdkit (202409.2-2 et autres)

[ Paquet source : rdkit  ]

Collection of cheminformatics and machine-learning software

RDKit is a Python/C++ based cheminformatics and machine-learning software environment. Features Include:

 * Chemical reaction handling and transforms
 * Substructure searching with SMARTS
 * Canonical SMILES
 * Molecule-molecule alignment
 * Large number of molecular descriptors, including topological,
   compositional, EState, SlogP/SMR, VSA and Feature-map vectors
 * Fragmentation using RECAP rules
 * 2D coordinate generation and depiction, including constrained depiction
 * 3D coordinate generation using geometry embedding
 * UFF and MMFF94 forcefields
 * Chirality support, including calculation of (R/S) stereochemistry codes
 * 2D pharmacophore searching
 * Fingerprinting, including Daylight-like, atom pairs, topological
   torsions, Morgan algorithm and MACCS keys
 * Calculation of shape similarity
 * Multi-molecule maximum common substructure
 * Machine-learning via clustering and information theory algorithms
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats RDKit supports include MDL Mol, PDB, SDF, TDT, SMILES and RDKit binary format.

Autres paquets associés à python3-rdkit

• dep: fonts-freefont-ttf

  polices TrueType Freefont Serif, Sans et Mono

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  bibliothèque Boost.Iostreams

• dep: libboost-numpy1.83.0 (>= 1.83.0) [non alpha, hppa, sparc64]

  extensions NumPy pour Boost.Python

• dep: libboost-numpy1.83.0-py312 [non alpha, hppa, sparc64]

  paquet virtuel fourni par libboost-numpy1.83.0

• dep: libboost-python1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  bibliothèque Boost.Python

• dep: libboost-python1.74.0-py39 [hppa]

  Paquet indisponible

• dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0) [non hppa]

  bibliothèque Boost.Python

• dep: libboost-python1.83.0-py312 [non hppa]

  paquet virtuel fourni par libboost-python1.83.0

• dep: libboost-regex1.83.0-icu72 [sparc64]

  paquet virtuel fourni par libboost-regex1.83.0

• dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  bibliothèque de sérialisation pour C++

• dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0) [non hppa]

  bibliothèque de sérialisation pour C++

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  bibliothèque de système d'exploitation (par ex. gestion des diagnostics)

• dep: libc6 (>= 2.29) [hppa]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [m68k, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, hppa, m68k, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10) [non hppa]

  Bibliothèque graphique vectorielle Cairo 2D

• dep: libcoordgen3 (>= 3.0.0) [hppa]

  2D coordinate generation for chemical compounds

  dep: libcoordgen3 (>= 3.0.2) [non hppa]

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]

  moteur de fontes FreeType 2, fichiers de bibliothèques partagées

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libinchi1.07 (>= 1.07.1+dfsg) [sparc64]

  International Chemical Identifier (InChI) algorithm (library)

• dep: libmaeparser1 (>= 1.2.4) [hppa]

  parser for Schrödinger Maestro files

  dep: libmaeparser1 (>= 1.3.1) [sparc64]

• dep: libpython3.12t64 (>= 3.12.1) [alpha, sparc64]

  Shared Python runtime library (version 3.12)

• dep: libpython3.9 (>= 3.9.1) [hppa]

  Paquet indisponible

• dep: librdkit1 [hppa]

  Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)

• dep: librdkit1t64 (>= 202309.3) [alpha, sparc64]

  Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)

  dep: librdkit1t64 (>= 202409.2) [non alpha, hppa, sparc64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [non hppa, m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [hppa]

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.10) [hppa]

  dep: python3 (<< 3.13) [non hppa]

  dep: python3 (>= 3.12~) [non hppa]

  dep: python3 (>= 3.9~) [hppa]

• dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [hppa]

  gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [non hppa]

• dep: python3-numpy-abi9

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

• dep: rdkit-data

  Collection of cheminformatics and machine-learning software (data files)

• sug: rdkit-doc

  Collection of cheminformatics and machine-learning software (documentation)

Télécharger python3-rdkit

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	202309.3-4	4 105,1 ko	28 954,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	202409.2-2	4 387,2 ko	26 830,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	202409.2-2	4 078,4 ko	27 804,0 ko	[liste des fichiers]
armel	202409.2-2	3 722,5 ko	23 117,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	202409.2-2	3 833,0 ko	20 469,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	202009.5-2	3 843,8 ko	24 156,0 ko	[liste des fichiers]
i386	202409.2-2	4 441,0 ko	25 865,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	202409.2-2	4 153,6 ko	24 555,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	202409.2-2	3 988,7 ko	30 268,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	202409.2-2	4 170,0 ko	32 025,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	202409.2-2	4 219,2 ko	30 297,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	202409.2-2	4 302,6 ko	24 082,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	202409.2-2	4 185,1 ko	26 078,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	202309.3-6	3 957,3 ko	67 971,0 ko	[liste des fichiers]