[ ソース: rdkit ]
パッケージ: python3-rdkit (202409.2-2 など)
python3-rdkit に関するリンク
Debian の資源:
rdkit ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [www.rdkit.org]
類似のパッケージ:
Collection of cheminformatics and machine-learning software
RDKit is a Python/C++ based cheminformatics and machine-learning software environment. Features Include:
* Chemical reaction handling and transforms * Substructure searching with SMARTS * Canonical SMILES * Molecule-molecule alignment * Large number of molecular descriptors, including topological, compositional, EState, SlogP/SMR, VSA and Feature-map vectors * Fragmentation using RECAP rules * 2D coordinate generation and depiction, including constrained depiction * 3D coordinate generation using geometry embedding * UFF and MMFF94 forcefields * Chirality support, including calculation of (R/S) stereochemistry codes * 2D pharmacophore searching * Fingerprinting, including Daylight-like, atom pairs, topological torsions, Morgan algorithm and MACCS keys * Calculation of shape similarity * Multi-molecule maximum common substructure * Machine-learning via clustering and information theory algorithms * Gasteiger-Marsili partial charge calculation
File formats RDKit supports include MDL Mol, PDB, SDF, TDT, SMILES and RDKit binary format.
その他の python3-rdkit 関連パッケージ
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- dep: fonts-freefont-ttf
- Freefont Serif, Sans, Mono Truetype フォント
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- dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]
- Boost.Iostreams ライブラリ
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- dep: libboost-numpy1.83.0 (>= 1.83.0) [alpha, hppa, sparc64 以外]
- Boost.Python NumPy extensions
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- dep: libboost-numpy1.83.0-py312 [alpha, hppa, sparc64 以外]
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-numpy1.83.0
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- dep: libboost-python1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]
- Boost.Python Library
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- dep: libboost-python1.74.0-py39 [hppa]
- パッケージは利用できません
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- dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0) [hppa 以外]
- Boost.Python Library
-
- dep: libboost-python1.83.0-py312 [hppa 以外]
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-python1.83.0
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- dep: libboost-regex1.83.0-icu72 [sparc64]
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-regex1.83.0
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- dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]
- serialization library for C++
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- dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0) [hppa 以外]
- serialization library for C++
-
- dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
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- dep: libc6 (>= 2.29) [hppa]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.32) [m68k, ppc64, s390x, sparc64]
- dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, hppa, m68k, ppc64, s390x, sparc64 以外]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
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- dep: libcairo2 (>= 1.4.10) [hppa 以外]
- Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ
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- dep: libcoordgen3 (>= 3.0.0) [hppa]
- 2D coordinate generation for chemical compounds
- dep: libcoordgen3 (>= 3.0.2) [hppa 以外]
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- dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]
- FreeType 2 フォントエンジン共有ライブラリファイル
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 共有ライブラリ
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC 共有ライブラリ
-
- dep: libinchi1.07 (>= 1.07.1+dfsg) [sparc64]
- International Chemical Identifier (InChI) algorithm (library)
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- dep: libmaeparser1 (>= 1.2.4) [hppa]
- parser for Schrödinger Maestro files
- dep: libmaeparser1 (>= 1.3.1) [sparc64]
-
- dep: libpython3.12t64 (>= 3.12.1) [alpha, sparc64]
- Shared Python runtime library (version 3.12)
-
- dep: libpython3.9 (>= 3.9.1) [hppa]
- パッケージは利用できません
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- dep: librdkit1 [hppa]
- Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)
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- dep: librdkit1t64 (>= 202309.3) [alpha, sparc64]
- Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)
- dep: librdkit1t64 (>= 202409.2) [alpha, hppa, sparc64 以外]
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [hppa, m68k 以外]
- dep: libstdc++6 (>= 9) [hppa]
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.10) [hppa]
- dep: python3 (<< 3.13) [hppa 以外]
- dep: python3 (>= 3.12~) [hppa 以外]
- dep: python3 (>= 3.9~) [hppa]
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [hppa]
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [hppa 以外]
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- dep: python3-numpy-abi9
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
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- dep: rdkit-data
- Collection of cheminformatics and machine-learning software (data files)
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- sug: rdkit-doc
- Collection of cheminformatics and machine-learning software (documentation)
python3-rdkit のダウンロード
アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
---|---|---|---|---|
alpha (非公式の移植版) | 202309.3-4 | 4,105.1 kB | 28,954.0 kB | [ファイル一覧] |
amd64 | 202409.2-2 | 4,387.2 kB | 26,830.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 202409.2-2 | 4,078.4 kB | 27,804.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 202409.2-2 | 3,722.5 kB | 23,117.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 202409.2-2 | 3,833.0 kB | 20,469.0 kB | [ファイル一覧] |
hppa (非公式の移植版) | 202009.5-2 | 3,843.8 kB | 24,156.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 202409.2-2 | 4,441.0 kB | 25,865.0 kB | [ファイル一覧] |
m68k (非公式の移植版) | 202409.2-2 | 4,153.6 kB | 24,555.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 202409.2-2 | 3,988.7 kB | 30,268.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64 (非公式の移植版) | 202409.2-2 | 4,170.0 kB | 32,025.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 202409.2-2 | 4,219.2 kB | 30,297.0 kB | [ファイル一覧] |
riscv64 | 202409.2-2 | 4,302.6 kB | 24,082.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 202409.2-2 | 4,185.1 kB | 26,078.0 kB | [ファイル一覧] |
sparc64 (非公式の移植版) | 202309.3-6 | 3,957.3 kB | 67,971.0 kB | [ファイル一覧] |