Package: meryl (0~20150903+r2013-9 and others)

[ Source: kmer  ]

conteggio di k-meri in- e out-of-core e utilità

meryl calcola il contenuto di k-meri di sequenze genomiche. Il contenuto di k-meri è rappresentato come una lista di k-meri e il numero di volte che ognuno di essi appare nelle sequenze di input. Il k-mero può essere ristretto solamente al k-mero forward, solo a quello reverse o al k-mero canonico (lessicograficamente più piccolo del k-mero forward e reverse ad ogni posizione). Meryl può riportare l'istogramma dei conteggi, la lista dei k-meri e il loro conteggio o può effettuare operazioni matematiche o insiemistiche sui file dei dati elaborati.

Questo pacchetto fa parte della suite Kmer.

Other Packages Related to meryl

• dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [not ia64]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 5) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

• sug: gridengine-client

  utilità per la gestione di code di Grid Engine

Download meryl

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	209.2 kB	1,706.0 kB	[list of files]
amd64	0~20150903+r2013-9+b1	195.8 kB	1,458.0 kB	[list of files]
arm64	0~20150903+r2013-9+b1	189.4 kB	1,572.0 kB	[list of files]
armel	0~20150903+r2013-9+b1	201.0 kB	1,635.0 kB	[list of files]
armhf	0~20150903+r2013-9+b1	200.7 kB	1,379.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	281.6 kB	2,022.0 kB	[list of files]
i386	0~20150903+r2013-9+b1	233.7 kB	1,835.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0~20150903+r2013-8+b3	268.4 kB	2,565.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	244.2 kB	1,939.0 kB	[list of files]
mips64el	0~20150903+r2013-9+b1	213.3 kB	1,821.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	203.3 kB	1,834.0 kB	[list of files]
ppc64el	0~20150903+r2013-9+b1	209.9 kB	1,765.0 kB	[list of files]
riscv64	0~20150903+r2013-9+b1	213.9 kB	1,286.0 kB	[list of files]
s390x	0~20150903+r2013-9+b1	178.7 kB	1,483.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	280.7 kB	1,891.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	179.6 kB	7,480.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	199.3 kB	1,455.0 kB	[list of files]