Package: meryl (0~20150903+r2013-9 and others)

[ Source: kmer  ]

Tælning og redskaber til ind og ud af kerne i kmer

Meryl beregner kmer-indholdet for genomsekvenser. Kmer-indhold er repræsenteret som en liste af kmer'er og antallet af gange hver fremgår af sekvenserne. Kmer'en kan være begrænset til alene den fremadrettet kmer, kun den tidligere kmer, eller den kanoniske kmer (leksikografiske mindre ende den fremadrettede eller tidligere kmer på hver placering). Meryl kan rapportere histogrammet for antal, listen af kmer'er og deres antal, eller kan udføre matematiske og set-operationer på de behandlede datafiler.

Denne pakke er en del af Kmer-programpakken.

Other Packages Related to meryl

• dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [not ia64]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 5) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

• sug: gridengine-client

  Redskaber for Grid Engines køhåndtering

Download meryl

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	209.2 kB	1,706.0 kB	[list of files]
amd64	0~20150903+r2013-9+b1	195.8 kB	1,458.0 kB	[list of files]
arm64	0~20150903+r2013-9+b1	189.4 kB	1,572.0 kB	[list of files]
armel	0~20150903+r2013-9+b1	201.0 kB	1,635.0 kB	[list of files]
armhf	0~20150903+r2013-9+b1	200.7 kB	1,379.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	281.6 kB	2,022.0 kB	[list of files]
i386	0~20150903+r2013-9+b1	233.7 kB	1,835.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0~20150903+r2013-8+b3	268.4 kB	2,565.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	244.2 kB	1,939.0 kB	[list of files]
mips64el	0~20150903+r2013-9+b1	213.3 kB	1,821.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	203.3 kB	1,834.0 kB	[list of files]
ppc64el	0~20150903+r2013-9+b1	209.9 kB	1,765.0 kB	[list of files]
riscv64	0~20150903+r2013-9+b1	213.9 kB	1,286.0 kB	[list of files]
s390x	0~20150903+r2013-9+b1	178.7 kB	1,483.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	280.7 kB	1,891.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	179.6 kB	7,480.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0~20150903+r2013-9+b1	199.3 kB	1,455.0 kB	[list of files]