Package: bitseq (0.7.5+dfsg-6 and others)

[ Source: bitseq  ]

inferenza bayesiana di trascritti da dati di sequenziamento

BitSeq è un'applicazione per inferire livelli di espressione di trascritti individuali da dati di sequenziamento (RNA-Seq) e stimare l'espressione differenziale (DE) tra condizioni. Un vantaggio di questo approccio è la capacità di tenere conto sia dell'incertezza tecnica, sia dell'intrinseca varianza biologica al fine di evitare false identificazioni DE. Il contributo tecnico all'incertezza viene sia dalla profondità di lettura finita, sia dall'eventuale mappatura ambigua delle letture verso più trascritti.

Other Packages Related to bitseq

• dep: libc6 (>= 2.29) [not alpha, arm64, riscv64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x, x32]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11) [arm64, riscv64]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 11.2.0-3) [alpha]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [not alpha, arm64, riscv64]

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: python3-numpy

  veloce funzionalità per array per il linguaggio Python (Python 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  libreria di compressione - runtime

• sug: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

Download bitseq

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	363.8 kB	2,250.0 kB	[list of files]
amd64	0.7.5+dfsg-6	337.2 kB	1,927.0 kB	[list of files]
arm64	0.7.5+dfsg-6+b1	305.1 kB	2,216.0 kB	[list of files]
armel	0.7.5+dfsg-6	282.4 kB	1,606.0 kB	[list of files]
armhf	0.7.5+dfsg-6	286.8 kB	1,158.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	311.3 kB	1,720.0 kB	[list of files]
i386	0.7.5+dfsg-6	362.5 kB	2,022.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	317.5 kB	1,730.0 kB	[list of files]
mips64el	0.7.5+dfsg-6	320.9 kB	2,167.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	344.7 kB	2,855.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.7.5+dfsg-6	343.5 kB	2,471.0 kB	[list of files]
riscv64	0.7.5+dfsg-6+b2	335.9 kB	1,440.0 kB	[list of files]
s390x	0.7.5+dfsg-6	297.6 kB	1,955.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	360.8 kB	1,651.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	289.1 kB	1,793.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.7.5+dfsg-6	338.6 kB	1,766.0 kB	[list of files]