Package: bitseq (0.7.5+dfsg-6)

[ Source: bitseq  ]

inferenza bayesiana di trascritti da dati di sequenziamento

BitSeq è un'applicazione per inferire livelli di espressione di trascritti individuali da dati di sequenziamento (RNA-Seq) e stimare l'espressione differenziale (DE) tra condizioni. Un vantaggio di questo approccio è la capacità di tenere conto sia dell'incertezza tecnica, sia dell'intrinseca varianza biologica al fine di evitare false identificazioni DE. Il contributo tecnico all'incertezza viene sia dalla profondità di lettura finita, sia dall'eventuale mappatura ambigua delle letture verso più trascritti.

Other Packages Related to bitseq

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, mipsel, s390x]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-numpy

  veloce struttura per array per il linguaggio Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  libreria di compressione - runtime

• sug: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	337.2 kB	1,927.0 kB	[list of files]
arm64	298.0 kB	1,691.0 kB	[list of files]
armel	282.4 kB	1,606.0 kB	[list of files]
armhf	286.8 kB	1,158.0 kB	[list of files]
i386	362.5 kB	2,022.0 kB	[list of files]
mips64el	320.9 kB	2,167.0 kB	[list of files]
mipsel	324.2 kB	2,080.0 kB	[list of files]
ppc64el	343.5 kB	2,471.0 kB	[list of files]
s390x	297.6 kB	1,955.0 kB	[list of files]