パッケージ: bitseq (0.7.5+dfsg-6 など)

[ ソース: bitseq  ]

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

その他の bitseq 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29) [alpha, arm64, riscv64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 11) [arm64, riscv64]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 11.2.0-3) [alpha]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [alpha, arm64, riscv64 以外]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

bitseq のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	0.7.5+dfsg-6	363.8 kB	2,250.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	0.7.5+dfsg-6	337.2 kB	1,927.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.7.5+dfsg-6+b1	305.1 kB	2,216.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.7.5+dfsg-6	282.4 kB	1,606.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.7.5+dfsg-6	286.8 kB	1,158.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	0.7.5+dfsg-6	311.3 kB	1,720.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.7.5+dfsg-6	362.5 kB	2,022.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	0.7.5+dfsg-6	317.5 kB	1,730.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.7.5+dfsg-6	320.9 kB	2,167.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.7.5+dfsg-6	344.7 kB	2,855.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.7.5+dfsg-6	343.5 kB	2,471.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.7.5+dfsg-6+b2	335.9 kB	1,440.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.7.5+dfsg-6	297.6 kB	1,955.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	0.7.5+dfsg-6	360.8 kB	1,651.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0.7.5+dfsg-6	289.1 kB	1,793.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.7.5+dfsg-6	338.6 kB	1,766.0 kB	[ファイル一覧]