Package: libbwa-dev (0.7.17-8~0exp) [debports]

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Experimental package

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file sorgenti di Burrows-Wheeler Aligner

BWA è un pacchetto software per mappare sequenze con bassa divergenza rispetto a vasti genomi di riferimento, come il genoma umano. Consiste di tre algoritmi: BWA-backtrack, BWA-SW e BWA-MEM. Il primo è progettato per sequenze Illumina fino a 100pb, mentre gli altri due per sequenze più lunghe da 70pb a 1Mpb. BWA-MEM e BWA-SH condividono funzionalità simili, come gestione per lunghe sequenze e allineamenti spezzati, ma BWA-MEM, che è il più recente, è generalmente quello raccomandato per interrogazioni di alta qualità perché più veloce e più accurato. BWA-MEM ha prestazioni migliori anche rispetto a BWA-backtrack per sequenze Illumina 70-100pb.

Questo pacchetto contiene i file sorgenti per l'uso in altri programmi.

Other Packages Related to libbwa-dev

• sug: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

Download libbwa-dev

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ia64 (unofficial port)	208.3 kB	773.0 kB	[list of files]
riscv64 (unofficial port)	274.8 kB	2,034.0 kB	[list of files]