Package: libbwa-dev (0.7.17-7 and others)

[ Source: bwa  ]

file sorgenti di Burrows-Wheeler Aligner

BWA è un pacchetto software per mappare sequenze con bassa divergenza rispetto a vasti genomi di riferimento, come il genoma umano. Consiste di tre algoritmi: BWA-backtrack, BWA-SW e BWA-MEM. Il primo è progettato per sequenze Illumina fino a 100pb, mentre gli altri due per sequenze più lunghe da 70pb a 1Mpb. BWA-MEM e BWA-SH condividono funzionalità simili, come gestione per lunghe sequenze e allineamenti spezzati, ma BWA-MEM, che è il più recente, è generalmente quello raccomandato per interrogazioni di alta qualità perché più veloce e più accurato. BWA-MEM ha prestazioni migliori anche rispetto a BWA-backtrack per sequenze Illumina 70-100pb.

Questo pacchetto contiene i file sorgenti per l'uso in altri programmi.

Tags: Software Development: Libraries, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::devel-lib, role::program, Source Code, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

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• sug: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.7.17-7+b2	152.7 kB	471.0 kB	[list of files]
arm64	0.7.17-7+b2	143.1 kB	457.0 kB	[list of files]
armel	0.7.17-7+b2	143.6 kB	420.0 kB	[list of files]
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ppc64el	0.7.17-7+b2	170.0 kB	557.0 kB	[list of files]
s390x	0.7.17-7+b2	141.3 kB	472.0 kB	[list of files]