Paket: libbwa-dev (0.7.17-8~0exp und andere)

[ Quellcode: bwa  ]

Experimentelles Paket

Warnung: Dieses Paket stammt aus der Experimental-Distribution. Dies bedeutet, dass es höchstwahrscheinlich instabil oder fehlerhaft ist und sogar Datenverlust verursachen kann. Bitte lesen Sie den Changelog und andere möglicherweise verfügbare Dokumentation, bevor Sie es benutzen.

Burrows-Wheeler Aligner source files

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

This package contains the source files for use in other programs.

Markierungen: Software-Entwicklung: Bibliotheken, Feld: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: role::devel-lib, role::program, Quellcode, Zweck: use::comparing, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu libbwa-dev

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

libbwa-dev herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.7.17-8~0exp	170,5 kB	630,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.7.17-8~0exp	152,5 kB	470,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.7.17-8~0exp	142,9 kB	456,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.7.17-8~0exp	143,3 kB	419,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.7.17-8~0exp	143,9 kB	352,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.7.17-8~0exp	169,2 kB	480,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.7.17-8~0exp	168,2 kB	478,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.7.17-8~0exp	208,3 kB	773,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.7.17-8~0exp	147,1 kB	439,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.7.17-8~0exp	157,0 kB	551,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.7.17-8~0exp	161,6 kB	540,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.7.17-8~0exp	169,8 kB	556,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.7.17-8~0exp+b1	294,0 kB	2.195,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.7.17-8~0exp	141,1 kB	471,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.7.17-8~0exp	197,2 kB	428,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.7.17-8~0exp	137,2 kB	467,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.7.17-8~0exp	156,4 kB	440,0 kB	[Liste der Dateien]