Package: velvet (1.2.10+dfsg1-5)

[ Source: velvet  ]

assemblatore di sequenze di acidi nucleici da sequenze molto corte

Velvet è un assemblatore genomico de novo progettato specificatamente per le tecnologie di sequenziamento basate su sequenze corte, come Solexa o 454, sviluppato da Daniel Zerbino e Ewan Birney all'European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), vicino a Cambridge, in Gran Bretagna.

Velvet attualmente accetta sequenze molto corte, rimuove errori e poi produce frammenti contigui unici di alta qualità. Poi usa informazioni sulle paired-read, se disponibili, per recuperare le aree ripetute tra i vari frammenti contigui.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

Other Packages Related to velvet

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  libreria di compressione - runtime

• sug: velvet-example

  dati di esempio per l'assemblatore di sequenze Velvet

Download velvet

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	668.3 kB	1,302.0 kB	[list of files]
arm64	635.6 kB	1,190.0 kB	[list of files]
armhf	649.0 kB	1,070.0 kB	[list of files]
i386	694.7 kB	1,494.0 kB	[list of files]