Пакет: velvet (1.2.10+dfsg1-5)

[ Источник: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к velvet

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  библиотека сжатия

• sug: velvet-example

  Example data for the Velvet sequence assembler

Загрузка velvet

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	668,3 Кб	1 302,0 Кб	[список файлов]
arm64	635,6 Кб	1 190,0 Кб	[список файлов]
armhf	649,0 Кб	1 070,0 Кб	[список файлов]
i386	694,7 Кб	1 494,0 Кб	[список файлов]