Package: seqtk (1.3-1)

[ Source: seqtk  ]

strumento veloce e leggero per elaborare sequenze in formato FASTA o FASTQ

Attualmente, seqtk gestisce il taglio basato sulla qualità con l'algoritmo phred, convertendo fastq in fasta, sequenze complementari inverse, l'estrazione o il mascheramento di sottosequenze in regioni date in un file BED/elenco di nomi e altro. Contiene un modulo di sottocampionamento per campionare esattamente n sequenze o una frazione di sequenze.

seqtk gestisce file di input sia fasta sia fastq, che possono opzionalmente essere compressi con gzip.

Other Packages Related to seqtk

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.3) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	30.0 kB	83.0 kB	[list of files]
arm64	28.2 kB	79.0 kB	[list of files]
armhf	28.0 kB	63.0 kB	[list of files]
i386	32.8 kB	91.0 kB	[list of files]