Paket: seqtk (1.3-1)

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Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

Currently, seqtk supports quality based trimming with the phred algorithm, converting fastq to fasta, reverse complementing sequences, extracting or masking subsequences in regions given in a BED/name list file, and more. It contains a subsampling module to sample exactly n sequences or a fraction of sequences.

Seqtk supports both fasta and fastq input files, which can be optionally gzip compressed.

Andere Pakete mit Bezug zu seqtk

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.3) [i386]

dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

seqtk herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	30,0 kB	83,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	28,2 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	28,0 kB	63,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	32,8 kB	91,0 kB	[Liste der Dateien]