Package: seqtk (1.4-2 and others)

[ Source: seqtk  ]

strumento veloce e leggero per elaborare sequenze in formato FASTA o FASTQ

Attualmente, seqtk gestisce il taglio basato sulla qualità con l'algoritmo phred, convertendo fastq in fasta, sequenze complementari inverse, l'estrazione o il mascheramento di sottosequenze in regioni date in un file BED/elenco di nomi e altro. Contiene un modulo di sottocampionamento per campionare esattamente n sequenze o una frazione di sequenze.

seqtk gestisce file di input sia fasta sia fastq, che possono opzionalmente essere compressi con gzip.

Other Packages Related to seqtk

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download seqtk

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.4-2	33.8 kB	95.0 kB	[list of files]
arm64	1.4-2+b1	32.2 kB	88.0 kB	[list of files]
armel	1.4-2	32.3 kB	91.0 kB	[list of files]
armhf	1.4-2	32.0 kB	71.0 kB	[list of files]
i386	1.4-2	37.3 kB	103.0 kB	[list of files]
mips64el	1.4-2	32.1 kB	154.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.4-2	37.2 kB	151.0 kB	[list of files]
riscv64	1.4-2+b1	34.7 kB	80.0 kB	[list of files]
s390x	1.4-2	33.9 kB	95.0 kB	[list of files]