Paket: seqtk (1.3-1)

Länkar för seqtk

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet seqtk:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Andreas Tille (QA-sida)
Brad Chapman (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

Currently, seqtk supports quality based trimming with the phred algorithm, converting fastq to fasta, reverse complementing sequences, extracting or masking subsequences in regions given in a BED/name list file, and more. It contains a subsampling module to sample exactly n sequences or a fraction of sequences.

Seqtk supports both fasta and fastq input files, which can be optionally gzip compressed.

Andra paket besläktade med seqtk

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.3) [i386]

dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta seqtk

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	30,0 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	28,2 kbyte	79,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	28,0 kbyte	63,0 kbyte	[filförteckning]
i386	32,8 kbyte	91,0 kbyte	[filförteckning]