Package: python-biopython (1.73+dfsg-1)

[ Source: python-biopython  ]

libreria Python per bioinformatica (implementata in Python 2)

Il progetto Biopython è un'associazione internazionale di sviluppatori di strumenti Python disponibili liberamente per i calcoli biologici molecolari.

È uno sforzo collaborativo distribuito per sviluppare librerie e applicazioni Python che si rivolgono verso i bisogni dei lavori in bioinformatica attuali e futuri. Il codice sorgente è reso disponibile sotto la licenza Biopython, che è estremamente liberale e compatibile con pressoché qualsiasi licenza esistente. Il progetto lavora accanto alla Open Bioinformatics Foundation, che generosamente fornisce lo spazio web e CVS per il progetto.

Questo pacchetto è per la versione 2 di Python.

Tags: Software Development: Python Development, Libraries, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: Python, Role: role::devel-lib, role::shared-lib

Other Packages Related to python-biopython

• dep: libc6 (>= 2.4)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione Python 2)

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7~)

• dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  aggiunge una veloce struttura per array al linguaggio Python

• dep: python-numpy-abi9

  virtual package provided by python-numpy

• dep: python-reportlab

  libreria ReportLab per creare documenti PDF usando Python

• rec: ncbi-blast+

  suite di prossima generazione degli strumenti di ricerca di sequenze BLAST

• rec: python-biopython-doc (= 1.73+dfsg-1)

  documentazione per la libreria Biopython

• sug: clustalo

  programma generico di allineamento di sequenze multiple per proteine

• sug: clustalw

  allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi

• sug: dialign

  allineamenti multipli di sequenze basati su segmenti

• sug: dssp

  assegnazione della struttura secondaria di una proteina in base alla struttura 3D

• sug: emboss

  suite software open source europea per la biologia molecolare

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  programma per allineamenti multipli per sequenze aminoacidiche o nucleotidiche

• sug: muscle

  programma per allineamenti multipli di sequenze proteiche

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  pacchetto di programmi per inferire alberi filogenetici

• sug: phyml

  stime filogenetiche usando il metodo della massima verosimiglianza

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  kit per allineamenti probabilistici di sequenze di DNA, codoni e amminoacidi

• sug: probcons

  allineamenti multipli di sequenze probabilistici basati sulla coerenza

• sug: python-matplotlib

  sistema di tracciamento grafici basato su Python in uno stile simile a Matlab

• sug: python-mysqldb

  interfaccia Python per MySQL

• sug: python-pil

  Python Imaging Library (fork Pillow)

• sug: python-psycopg2

  modulo Python per PostgreSQL

• sug: python-rdflib (>= 4)

  libreria Python contenente un triplestore RDF e un analizzatore/serializzatore RDF

• sug: python-renderpm

  interfaccia Python per il rendering di basso livello

• sug: python-scipy

  strumenti scientifici per Python

• sug: python-tk

  Tkinter - scrittura di applicazioni Tk con Python 2

• sug: raxml

  RAxML (Randomized Axelerated Maximum Likelihood) di alberi filogenetici

• sug: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

• sug: t-coffee

  allineamento di sequenze multiple

• sug: w3-dtd-mathml

  DTD per Mathematical Markup Language V2.0

• sug: wise (>= 2.4.1-16)

  confronto tra biopolimeri, come DNA e sequenze proteiche

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armhf	1,282.2 kB	8,822.0 kB	[list of files]