Pakiet: python-biopython (1.73+dfsg-1)

[ Pakiet źródłowy: python-biopython  ]

Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)

The Biopython Project is an international association of developers of freely available Python tools for computational molecular biology.

It is a distributed collaborative effort to develop Python libraries and applications which address the needs of current and future work in bioinformatics. The source code is made available under the Biopython License, which is extremely liberal and compatible with almost every license in the world. The project works along with the Open Bioinformatics Foundation, who generously provide web and CVS space for the project.

This package is targeting Python version 2.

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Rozwijanie w języku Python, Biblioteki, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: Python, Rola: role::devel-lib, role::shared-lib

Inne pakiety związane z python-biopython

• dep: libc6 (>= 2.4)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: python

  Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7~)

• dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  Szybkie dodawanie obiektów tablicy, moduł do języka Python

• dep: python-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python-numpy

• dep: python-reportlab

  ReportLab library to create PDF documents using Python

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• rec: python-biopython-doc (= 1.73+dfsg-1)

  Documentation for the Biopython library

• sug: clustalo

  General purpose multiple sequence alignment program for proteins

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: dialign

  Dopasowanie wielu sekwencji w oparciu o segmenty

• sug: dssp

  protein secondary structure assignment based on 3D structure

• sug: emboss

  European molecular biology open software suite

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• sug: muscle

  Multiple alignment program of protein sequences

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: phyml

  Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

• sug: python-matplotlib

  System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

• sug: python-mysqldb

  Python interface to MySQL

• sug: python-pil

  Python Imaging Library (Pillow fork)

• sug: python-psycopg2

  Python module for PostgreSQL

• sug: python-rdflib (>= 4)

  Python library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers

• sug: python-renderpm

  python low level render interface

• sug: python-scipy

  scientific tools for Python

• sug: python-tk

  Tkinter - pisanie aplikacji Tk w języku Python2

• sug: raxml

  Randomizowane maksymalne prawdopodobieństwo drzew filogenetycznych

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

• sug: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

• sug: w3-dtd-mathml

  Mathematical Markup Language V2.0 DTD

• sug: wise (>= 2.4.1-16)

  comparison of biopolymers, like DNA and protein sequences

Pobieranie python-biopython

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
armhf	1 282,2 KiB	8 822,0 KiB	[lista plików]